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Illumina“快”布局，聯合IBM攻克腫瘤精準醫(yī)學壁壘

[2017/1/11]

1月10日，測序巨頭Illumina宣布了與皇家飛利浦、IBM的合作協議，旨在共同推進癌癥基因組數據的分析和解釋。從合作的內容來看，雙方的最終目的是“快”——快速解讀數據，幫助研究人員快速實現腫瘤精準醫(yī)療。
 
　　1月10日，Illumina推出最新測序儀NovaSeq系統的消息刷爆了朋友圈，該系統最引人注目的特點莫過于將基因組測序價格降低至100美元。該系統的使用場景為基因組測序、液體活檢、腫瘤/正常組織對照測序、群體基因組測序(PopSeq)，為比對腫瘤-健康組織的超級深度測序(ultra-deep sequencing)、與復雜疾病相關的大規(guī)模基因變異分析等領域提供全新的市場。
 

　　也在1月10日，Illumina在腫瘤精準醫(yī)療領域做了另外的兩個布局，宣布了與皇家飛利浦、IBM的合作協議，旨在共同推進癌癥基因組數據的分析和解釋。從合作的內容來看，雙方的最終目的是“快”——快速解讀數據，快速實現腫瘤精準醫(yī)療。
 
　　攜手飛利浦，在全球醫(yī)療系統中推廣Illumina測序系統　　Illumina與皇家飛利浦戰(zhàn)略合作的目標是將Illumina的測序系統和飛利浦的 IntelliSpace Genomics臨床信息平臺整合，并協調營銷和銷售的解決方案。
 
　　基因組數據將在Illumina的NGS數據管理和分析的云基因組計算環(huán)境(BaseSpace Sequence Hub)中產出，并利用飛利浦的 IntelliSpace Genomics腫瘤解決方案進行加工，該解決方案的數據包含了放射科、免疫組織化學、數字化病理學、醫(yī)療記錄和實驗室檢測。采用該解決方案的實驗室將獲得先進的分析方法、深度學習技術、文獻以及其他指南指導等。
 
　　此外，飛利浦和Illumina計劃在臨床研究中開展合作，共同推進腫瘤精準醫(yī)學的進程。飛利浦Connected Care and Health Informatics 首席執(zhí)行官Jeroen Tas在一份聲明中表示，至今大多數使用基因組數據來輔助癌癥精準診斷和提高治療只在學術領域中得以實現。通過與Illumina的合作，我們將為更多的實驗室和護理提供者揭開基因組學的價值，幫助他們以更快的速度來推進基因組計劃，并為患者提供更精準的藥物，實現更加有效的治療。
 
　　Illumina首席執(zhí)行官Francis deSouza在一份聲明中補充道，“我們相信這種合作將為Illumina的下一代測序系統納入美國甚至世界醫(yī)療衛(wèi)生系統提供優(yōu)良的路徑。”
 
　　攜手IBM，快速生成基因組改變的注釋報告
 

　　另外，IBM和Illumina計劃將 Watson for Genomics和Illumina的BaseSpace相整合，旨在腫瘤測序過程中標準化和簡化基因組數據的解讀。
 
　　研究人員使用Illumina的TruSight Tumor 170 癌癥測序panel將獲得有助于解釋變量數據的信息。尤其是Watson for Genomics 將讀取TruSight Tumor 170生成的遺傳信息文件，梳理專業(yè)指南、醫(yī)學文獻、臨床試驗標準、基因組變化的其他來源信息，該系統將在數分鐘內生成包含每個基因組改變的注釋報告。
 
　　每個月將增加10000篇科學論文數據和100個新臨床試驗數據的Watson for Genomics軟件，將在今年初為 TruSight Tumor 170提供支持，也就是說使用TruSight Tumor 170的Watson for Genomics軟件將于今年初上市。
 
　　Illumina腫瘤學副總裁在一份聲明中表示，為了能夠在大范圍內實現精準醫(yī)療，我們需要新的工具來克服基因組研究的數據分析壁壘。聯合Illumina的方法與Watson的強大力量，我們希望能夠在很快的周期內生成基因組變化的報告。
 
　　IBM Watson Health總經理DiSanzo在一份聲明中表示，這次合作為更加系統化的腫瘤基因組學研究提供了基礎。使用Illumina系統來獲取寶貴的基因組信息，再由Wasrson系統進行可靠的、標準化的基因組解釋，我們希望能夠幫助研究人員快速實現腫瘤精準醫(yī)療。